Konami, Metal Gear Solid: HD Collection için Japonya ve Batı arasında içerik farklılıkları sunuyor. Oyunun Japonya sürümünü alacak olanlar ilk Metal Gear Solid oyununa da sahip olacaklar.
Japonya'da Metal Gear Solid 2, Metal Gear Solid 3 kutulu olarak sunulacakken Metal Gear Solid'i ise Game Archives bölümünden indirmemiz gerekecek. HD Collection'daki MGS 3 Subsistance sürümü olduğu için Metal Gear 1 ve Metal Gear 2 de pakette bulunacak. Yani MG1, MG2, MGS, MGS2 ve MGS3 oyunun Japonya sürümünde yer alacak. MGS: Peace Walker ise Japonya'da ayrı olarak satılacak.
HD Collection'ın Batı sürümünde MGS2, MGS3 ve Peace Walker kutunun içinde gelecekken yine Metal Gear Solid 3'ün Subsistance sürümü Metal Gear 1 ve Metal Gear 2'yi barındıracak. Metal Gear Solid'i ise malesef kendimiz almamız gerekecek.