Son savaştan çok uzun yıllar geçti. Dünya artık insanların yaşamak için kullandığı bir yer değil. The Aragami'nin dehşet verici saldırıları dünyayı sarsmaya devam ediyor ve sefalet ile yıkım yaratıyor. Dünyayı kurtarmak ve dengeyi yeniden sağlamak için yeni kahramanlar - God Eater'lar - yükseliyor. Dünyanın dört bir yanındaki yerleri parçalara ayıran korkunç yeni Aragami'yi indirmek için diğer God Eater'lar ile birlikte çalışacaksın. Ancak bu tek göreviniz olmayacak, God Eater'lara bir şeyler oluyor ve karanlık ile aydınlık arasındaki çizgi hiç bu kadar ince olmamıştı... Savaş daha önce hiç olmadığı kadar acele ederken God Eater'ların ruhunu bağlayan lanetli zincirlerden kurtulmasının zamanı geldi...