IDOLA Phantasy Star Saga temel olarak sıra tabanlı savaşlar geliştirir. Savaş sistemini öğrenmesi oldukça kolaydır: takımınızın her bir üyesinin gerçekleştirebileceği saldırıyı seçmelisiniz. Bu doğru, her bir karakter farklı bir gruptadır ve ekranınızı görsel-işitsel havai fişeklerle dolduracak farklı saldırılar gerçekleştirebilirler.