Warzone 2100 diğer gerçek zamanlı strateji oyunlarına kıyasla büyük çaplı topçu silahları, radar ve karşı topçu ateşi teknolojilerine odaklanıyor ve oyun ilerledikçe daha sık oyun içi sinematikler, devasa bir araştırma ağacı ve araç tasarım sistemi sunuyor.
Senaryosunda, 21. yüzyılın sonlarında yeni NASDA stratejik savunma sisteminde kaynaklanan büyük bir arızadan dolayı dünya medeniyetleri nükleer saldırılar tarafından yok ediliyor. Hayatta kalmaya çalışanların çoğu küçük gruplar oluşturuyor. Siz ise daha organize ve savaş teknolojilerini kullanarak medeniyeti yeniden kurmaya çalışan Proje adındaki bir grubun üyesisiniz.