XCOM: Enemy Unknown son dönemlerin en iyi strateji oyunları arasında yer alıyor. Fraxis'in bu başarı oyundan önce bazı prototipler geliştirdiği açıklandı. Bu prototipler oldukça başarısız olduğundan piyasaya sürülmemiş.
Firaxis'ten baş tasarımcı Jake Solomon'ın açıklamalarına göre ilk olarak 2003 yılında bir prototip hazırlanmış. Bu prototip oldukça kötü olduğundan geliştirilme süreci durmuş. Solomon iyiki de geliştirme sürecinin durduğunu söylüyor.
2008 yılında ise Fraxis ilk XCOM oyununu yeniden yapmak için kolları sıvamış. Orijinal oyun mekaniklerinin kullanılması planlanıyormuş, ama geliştirici ekip daha geniş ve karmaşık sisteme sahip olan bir oyun yapmaya karar vermiş. Bunun sonucunda da karşımıza Enemy Unknown çıkmış.