Sadece Assassin's Creed serisi değil, genel olarak Ubisoft'un neredeyse bütün oyunlarının PC sürümleri bu platformdaki oyuncuların başına biraz dert açmıştır. Gerek geç gelen yapımlar, gerek DRM sistemiyle gelen sorunlar, Assassin's Creed III'te olabilecek karışıklıkları da kafalarımıza davet etti.
Konuyla ilgili oyunun yönetmeniyle röportaj yapan Gamespy, yönetmenin PC platformu hakkındaki görüşlerini aldı. PC'lere sıcak davranan Alex Hutchinson, "PC platformunu kesinlikle destekliyoruz. PC'leri seviyoruz fakat PC oyuncularına da oyunu oynarken Gamepadleri öneriyoruz." derken,
"Açıkça söylemek gerekirse mouse ve klavye ikilisinin üstüne çok ayrıntılı şekilde düşmüyoruz. Eğer PC oyuncusuysanız ve Assassin's Creed III oynamak istiyorsanız, Gamepad sizin için daha iyi." açıklamalarında bulundu.