Nintendo, yenilenen ve biraz daha küçülen Wii'nin yeni tasarım nedeniyle eskiye uyumlu olmayacağını duyurdu. Bu, artık yeni modellerde üst kapağın altında GameCube kontrolcüleri için saklanan slotları bulamayacaksınız anlamına geliyor.
Bu slotların ve memory kart slotlarının çıkartılması dışında eski GameCube oyunlarını da oynayamayacaksınız. Bu yeni tasarım Wii'lerde hareket algılayıcı kontrolcülerle oynamak istemiyorsanız klasik kontrolcüleri kullanmanız gerekiyor.
2006 çıkan konsol ilk defa tasarım değişikliğine giderken bunun Wii U'ya geçiş hazırlıkları olduğu düşünülüyor. Ayrıca artık konsol yatay olarak konumlandırmaya daha müsait olacak (Dikeye nazaran). Wii Party, Wii Sports ve yenilenmiş Wii Remote Plus ile Nunchuck paket içerisinde bulunuyor.