Obsidian Entertainment tarafından geliştirilen Alpha Protocol büyük beklenti olmasına rağmen çoğu oyun otoritesinden yüksek not alamamıştı. Bu notlar oyunun satışlarına da yansıyınca yayıncı Sega 2. oyunu düşünmediğini açıkladı.
Sega'nın Batı'daki en büyük sorumlusu Mike Hayes "Ticari olarak konuşalım, oyun beklediğimiz kadar satmadı, bu nedenle devamını düşünmüyoruz." sözleriyle Alpha Protocol 2'yi düşünmediklerini söyledi.
Modern zamanda geçen ilk aksiyon-casusluk rpg oyunu Alpha Protocol güçlü karakterleri ve diyalog sistemi ile dikkat çekmişti, fakat oyundaki buglar ve grafiksel kalitenin yüksek olmaması oyuncuları soğutan etkenler arasında görülebilir.
Alpha Protocol'ın geliştiricisi Obsidian Entertainment şu sıralar Fallout: New Vegas'ı geliştiriyor ve nasıl bir performans sergileyecekleri merak ediliyor.