Metal Gear Solid V: Ground Zeroes ve Metal Gear Solid V: The Phantom Pain'in hikaye olarak birbiriyle doğrudan bağlantılı noktalarının olduğunu biliyoruz. Hideo Kojima iki oyun arasında kayıt dosyalarının taşınmasıyla daha derin bağlantıların kurulacağını söylüyor.
"Tabi ki, Ground Zeroes'taki kayıt dosyalarınızı The Phantom Pain'de kullanabileceksiniz. Ground Zeroes'ta kurtardığınız rehinler artınca bunların The Phantom Pain'e etkisi artacak. Çok fazla detaya giremem, ama Ground Zeroes'u satın alanlar The Phantom Pain'de çeşitli avantajlar ve bonuslara sahip olacaklar. Uç bir örnek verecek olursak, oyun kayıtlarınız ve puanlarınız taşınabilecek."
Oyuncuların Ground Zeroes'u oynamasının The Phantom Pain'e başladıklarını noktayı değiştirmeyeceğini de belirten Kojima, herkesin The Phantom Pain'e aynı noktadan başlayacağını, ama bazı detayların sadece Ground Zeroes'u oynayanlar tarafından anlaşılabileceğini söylüyor.